博物馆本身即为孔庙旧址，其建置可追溯到北宋末年。照壁、牌坊、泮池、棂星门、华表、戟门、碑亭、两庑等明清建筑保存至今，并遵循着孔庙固有的建筑格局，组成了一个绿树掩映、古朴典雅的庭院式建筑群。

碑林博物馆以其独有的特色成为中华民族历史文物宝库中的一个重要组成部分，被誉为“中国最大的石质书库”，是全国 18 个国家级特殊旅游参观点及AAAA 级旅游点之一，被列入《中国世界文化遗产预备名单》。

碑林最初是北宋吕大忠等人为保藏因唐末五代战乱而委弃市井的唐《石台孝经》《开成石经》及颜真卿、柳林屏公权等所书的著名石碑而兴建的。碑林内容丰富,它既是我国古代书法艺术的宝库,又汇集了古代的文献典籍和石刻图案;记述了我国文化发展的部分成就,反映了中外文化交流的史实,因而驰名中外。